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盡管獲得用鋼瓶儲運的高純氮氣并不難，但是，和使用氮氣鋼瓶相比，使用氣體發生器卻有許多顯而易見的優勢。使用氣體發生器消除了鋼瓶在搬運過程中所帶來的安全隱患，同時，氣體發生器的性價比非常高。許多用戶反饋，氣體發生器的成本可以在短短的一年內收回。一旦氣體發生器與質譜儀連接并供氣，質譜儀被氮氣源污染的概率就大大降低，但是，若用戶使用的氮氣鋼瓶，外來的污染物極有可能在更換氮氣鋼瓶的過程中進入到檢測器，從而污染檢測器。下表中羅列出了氮氣發生器較氮氣鋼瓶而言的一些優勢：
氣體發生器和鋼瓶的對比 ：
| 氣體發生器 | 氣體鋼瓶 | |
| 便捷 | ●氣體按需生產 ●氣體的純度，流速和壓力穩定不變 ●在檢測器與氣源之間沒有間隔，杜絕了污染的產生 | ●氣體的純度不一致 ●氣體的流速不穩定 ●需要經常更換氮氣鋼瓶 |
| 性價比 | ●維護成本很低 ●成本收回快/投資回報率高 ●省去了鋼瓶租賃的費用，交通費和危險品管理費用 | ●鋼瓶的搬運和租賃成本逐年上升 ●鋼瓶中氣體用盡導致儀器停機的時間成本 |
| 安全因素 | ●實驗室中無易爆氣體儲藏 ●氣體發生器能維持實驗室的氣壓平衡 ●氣體發生器消除了引進外來物質污染的可能性 | ●氣體壓縮儲藏，有爆炸危險存在 ●鋼瓶的搬運和連接過程中帶來的安全隱患 ●鋼瓶使用過程中會加壓到2000psi左右的高壓 |
| 空間和占地 | ●氣體發生器體積小巧，為節省空間而設計 ●發生器結構緊湊，性能穩定可靠，只需極少的服務和維護 | ●有氮氣鋼瓶的儲藏數量決定，若儲藏的場地按面積的大小來收費，那么，鋼瓶的儲放性價比極低 |
| 消耗速率 | ●氣體隨用隨生產，無需擔心氣體用完 | ●取決于氣體鋼瓶使用情況，鋼瓶中的氮氣能在短短的4-6小時內消耗完 |
● 方便，無需搬運和收集氮氣鋼瓶 ●節能 ●環保，減少二氧化碳的排放 | ●在氮氣的抽取，冷濾蒸餾，加壓，搬運過程中會有大量的能量消耗 |
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